基因组中心于2012年8月份开始筹建，分二期建设。2013年8月完成第一期建设，建成公共实验室290.4 m2，电泳室14.4 m2，摇菌室38.3 m2，洁净室（组织培养室）133 m2，显微操作室13.2 m2，人工气候室70.9 m2，RNA室33.3 m2，建库室50.8 m2，测序间25 m2，服务器室25.8 m2，低温实验室11 m2，超低温冰箱室16 m2，报告厅69.7 m2，会议室58.6 m2，学生学习间57.9 m2。第二期建设于2016年5月份完成，扩建室内人工气候室220 m2。中心总的使用面积约3000 m2。
除普通分子生物学平台外，建立了五大研究平台：
1. 基因组学平台：建设了以HiSeq 2500二代测序仪、PacBio RSⅡ三代测序系统、BioNano Irys单分子基因组成像分析系统为主的基因组研究平台。
2. 生物信息学分析平台：拥有两台计算节点、两台存储节点以及一套计算集群系统。
3. 细胞生物学平台：具备Olympus电动荧光显镜、Leica荧光倒置显微镜、Nikon荧光体视显微镜、Eppendorf显微操作系统等细胞学实验仪器。
4. 植物遗传转化平台：设组培区、高压准备区、洗涤干燥区、缓冲区和接种区，配置了基因枪系统等。
5. 植物生长人工气候室：已建设300 m2的现代化人工气候室，用于植物材料的培养。
除此以外，公共实验区域设置有专门的电泳间，PCR间，摇菌室，药品存贮间，耗材存贮间等。电泳室配备Bio-Rad PowerPac Basic电泳仪和Bio-Rad Gel Doc™XR凝胶成像系统。凝胶成像系统支持多种检测方法，包括荧光，比色，光密度，化学发光和化学荧光等，由 Image Lab™ 软件控制，全自动获取图像，该系统配合电泳系统使用，适用于限制性酶解，核酸扩增，基因指纹，RFLP，蛋白纯度和特征分析。摇菌室配备恒温振荡培养箱、落地式高性能高速冷冻离心机、孵化炉（杂交箱）、电穿孔仪、-86℃超低温冰箱、 超净工作台等。
