加入收藏 | English
     
当前位置: 首页  研究队伍  中心PI

张积森


基因组与生物技术研究中心   发布时间: 2017-06-28   信息员:  

张积森、教授,博士生导师,基因组与生物技术研究中心常务副主任。从事以甘蔗、龙眼、木瓜、菠萝为主的热带、亚热带作物基因组及其生物学性状研究,特别对甘蔗的基因组学及其重要性状的分子生物学进行了有系统的研究。先后主持863子课题、国家自然基金、福建省农技体系建设等研究项目8项;参与国家自然科学基金项目和农业部项目等项目10项。在Nature Genetics,Genome Research,Genome biology,Current Opinion in Plant Biology,Plant Cell & Environment,Journal of Experimental Botany等刊物上发表各类文章60多篇。

主要研究方向:
1.甘蔗基因组学及其重要生物学性状基因功能;
2.热带、亚热带植物基因组结构与功能;
3.禾本科植物基因组剂量效应及杂种优势与生物量形成关系。
联系方式:zjisen@gmail.com  
                  zjisen@126.com
发表文章:(共发表各类论文61篇,其中第一作者或通迅作者29篇)
1)Jisen Zhang, Anupma Sharma, Qingyi Yu, Jianping Wang, Leiting Li, Lin Zhu,Xingtan Zhang, Youqiang Chen, Ray Ming. Strong directional selection in the Bru1 Genomic Region in Saccharum spontaneum. .BMC Genomics(修改中)
2)Liwu Zhang, Ray Ming, Jisen Zhang, Aifen Tao, Pingping Fang and Jianmin Qi. (2015).De novo transcriptome sequence and identification of major bast-related genes involved in cellulose biosynthesis in jute (Corchorus capsularis L.) .BMC Genomics. 15;16(1):1062. doi: 10.1186/s12864-015-2256-z.(影响因子3.99).
3)Qing Zhang,Weichang Hu, Fan Zhu, Liming Wang, Qingyi Yu, Ray Ming, Jisen Zhang*(2016) .Structure, Phylogeny, Allelic Haplotypes and Expression of Sucrose Transporter Gene Families in Saccharum. BMC Genomics.17:88. DOI: 10.1186/s12864-016-2419-6(*通讯作者).
4)Ming Ray*...Jisen Zhang...et al. (2015) The pineapple genome and the evolution of CAM photosynthesis. Nature Genetics . doi:10.1038/ng.3435) (排名11/70,影响因子29.8)
5)Robert VanBuren*, Fanchang Zeng*, Cuixia Chen*, Jisen Zhang*, Ching Man Wai, Jennifer Han, Rishi Aryal, Andrea R. Gschwend, Jianping Wang, Jong-Kuk Na, Lixian Huang, Lingmao Zhang, Wenjing Miao, Jiqing Gou, Jie Arro, Romain Guyot, Richard C. Moore, Ming-Li Wang, Francis Zee, Deborah Charlesworth, Paul H. Moore, Qingyi Yu, Ray Ming (2015). Origin and domestication of papaya Yh chromosome. Genome Research, 25:524–533. doi: 10.1101/gr.183905.114. (*共同第一作者,影响因子13.8)
6)Tang H, X Zhang, C Miao, J Zhang, R Ming, JC Schnable, PS Schnable, E Lyons, J Lu (2015).Robust scaffold ordering based on multiple maps. Genome Biology.16(1):3. doi:10.1186/s13059-014-0573-1.(影响因子10.5).
7)Jisen Zhang, Juan Liu., Ray. Ming. (2014). Genomic analysis of CAM plant pineapple. Journal of Experimental Botany. 65 (13): 3395-3404.doi:10.1093/jxb/eru101 (影响因子5.52).
8)Jisen Zhang,. Boualem A., Bendahmane A., Ray. Ming. (2014). Genomics of sex determination. Current Opinion in Plant Biology. 2014, 18:110–116. (影响因子7.85)
9)J. Sun *, J. Zhang *, C. LARUE, S. Huber (2011). Decrease in leaf sucrose synthesis leads to increased leaf starch turnover and decreased RuBP regeneration-limited photosynthesis but not Rubisco-limited photosynthesis in Arabidopsis null mutants of SPSA1.Plant, Cell & Environment. 34, 592–604.(*共同第一作者,影响因子6.96).
10)J. Zhang, J. Arro, Y. Chen, R. Ming ( 2013). Haplotype analysis of sucrose synthase gene family in three Saccharum species. BMC Genomics. 14:314.(影响因子3.99).
11)J. Zhang, C. Nagai, Q. Yu, Y. Pan, T. Ayala-Silva, R. Schnell, J. Comstock., A. Arumuganathan & R. Ming( 2012). Genome size variation in three Saccharum species. Euphytica.185:511–519.(影响因子1.69).
12)J. Zhang, Z. Zhang, Y. Wu, L. Chen, Q. Luo, J. Chen, X. Huang, Y. Cheng, Z. Wang (2012). ,2012, 31;44(10):615-21. doi: 10.3858/emm.2012.44.10.070.(SCI,影响因子2.48).
13)Jisen Zhang, Marvellous Zhou, James Walsh, Lin Zhu, Youqiang Chen, Ray Ming. Sugarcane. Chapter 23: Genetics and Genomics. Physiology, Biochemistry, and Functional Biology of Sugarcane, First Edition. Edited by Paul H. Moore and Frederik C. Botha .623-644. Published 2013 by John Wiley & Sons, Inc.(Book Chapter)
14)Lin Zhu, Jisen Zhang, Youqiang Chen, Hongyu Pan, Ray Ming. Identification and genes expression analysis of ATP-dependent phosphofructokinase family members among three Saccharum species. FunctionPlantBiology,2013,40(4):369-378. (SCI,影响因子2.9).
15)Haiping Xin , Jisen Zhang ,Wei Zhu ,Nian Wang, Peige Fang, Yuepeng Han, Ray Ming, Shaohua Li. The effects of artificial selection on sugar metabolism and transporter genes in grape. Tree Genetics & Genomics. DOI 10.1007/s11295-013-0643-7(SCI 2区,影响因子2.58).
16)Zhengchao Wang, Zhenghong Zhang, Yanqing Wu, Liyun Chen, Qianping Luo, Jisen Zhang, Jiajie Chen, Zimiao Luo, Xiaohong Huang, Yong Chen.:Effects of Echinomycin on Endothelin-2 Expression and Ovulation in Immature Rats Primed with Gonadotropins.Experimental and Molecular Medicine,2012, 31;44(10):615-21. doi: 10.3858/emm.2012.44.10.070.(SCI,影响因子2.48).
17)Ming, R., R. VanBuren, Y. Liu, M. Yang, Y. Han, L.-T. Li, Q. Zhang, M.-J. Kim, M.C. Schatz, M. Campbell, J. Li, J.E. Bowers, H. Tang, E. Lyons, A.A. Ferguson, G. Narzisi, D.R. Nelson, C.E. Blaby-Haas, A.R. Gschwend, Y. Jiao, J.P. Der, F. Zeng, J. Han, X. Min, K.A. Hudson, R. Singh, A.K.Grennan, S.J. Karpowicz, J.R. Watling, K. Ito, S.A. Robinson, M.E. Hudson, Q. Yu, T.C. Mockler, A. Carroll, Y. Zheng, R. Sunkar, R. Jia, N. Chen, J. Arro, C.M. Wai, A. Spence, Y. Han, L. Xu, J. Zhang, R. Peery, M.J. Haus, W. Xiong., J.A. Walsh, J. Wu, M.-L. Wang, Y.J. Zhu, R.E. Paull, A.B. Britt, C. Du, S.R. Downie, M.A. Schuler, T.P. Michael, S.P. Long, D.R. Ort, J.W. Schopf, D.R. Gang, N. Jiang, M. Yandell, C.W. dePamphilis, S.S. Merchant, A.H. Paterson, B.B. Buchanan, S. Li, J. Shen-Miller. 2013. Genome of the long-living Sacred lotus (Nelumbo nucifera Gaertn.) Genome Biology 14: R41.(影响因子10.03).
18)张清,胡伟长,张积森*植物蔗糖转运蛋白研究进展.热带作物学报.2015,37(01): 1-11.( *通讯作者)
19)陈毅鸿,张积森*植物果糖激酶基因家族演化及其功能.分子植物育种(*通讯作者,已接收)
20)池福铃,王丽珊,陈兰平,张清,陈由强,张积森*.甘蔗纤维素合成酶家族的基因组演化.北京:中国科技论文在线. [2015-01-29].http://www.paper.edu.cn/releasepaper/content/ 201501-504. ( *通讯作者)
21)王丽珊 林清凡 陈兰平 池福铃 郭春芳 张积森.茶树P5CS基因克隆及其在渗透和高盐胁迫下的表达分析.热带作物学报.2015,36(1): 68-75
22)陈兰平,陈由强,方静平,宋喜梅,叶冰莹,陈如凯,张积森*.甘蔗SPS 基因家族成员表达与糖分积累关系解析,热带作物学报.2014,35(7): 1354-1361.( *通讯作者)
23)张积森;郑月霞;邹丽娟;叶冰莹;陈如凯;陈由强.酵母单杂交方法步鉴定甘蔗SPSⅢ启动子调控序列.农业生物技术学报. 2012, 20(11): 1282~1290
24)张积森,郑月霞,方静平,高玉娜,郭春芳,叶冰莹,陈由强,陈如凯.甘蔗SPSIII基因启动子5侧翼的GUS表达载体构建.福建教育学院学报.2012(3): 118-121.
25)张积森,林清凡,方静平,邹丽娟,叶冰莹,陈由强,陈如凯.甘蔗SPS III启动子区ATCT-motif和CAT-box元件的酵母单杂交报告载体构建.福建师范大学学报(自然科学版). 2013, 29(1).
26)许玉林,郑月霞,叶冰莹,张积森,陈由强.一株纤维素降解真菌的筛选及鉴定.微生物学通报.2013, 40(2): 220-227.
27)郑月霞, 许玉林,张积森,叶冰莹,陈由强,陈如凯.甘蔗可溶性酸性转化酶基因的克隆及序列分析. 热带作物学报,2012,33(11): 2007-2011.
28)江安庆,苏轶,郑月霞,张积森,叶冰莹,陈由强. 植物蔗糖转运蛋白的研究进展.安徽农业科学.2011.39(34). 20938-20940,20974
29)魏芳,林燕环,叶冰莹,张积森陈由强.甘蔗根际土壤产木聚糖酶菌株的筛选及鉴定. 亚热带农业研究.2011.7( 3).201-205.
30)林燕环,魏芳,叶冰莹,张积森,陈由强.酿酒酵母ADH2基因沉默表达载体的构建. 亚热带农业研究.2011.7( 3).197-200.
31)苏轶,江安庆,逯平杰, 张积森,叶冰莹,陈由强.超声辅助萃取HPLC法测定烟草中蔗糖、果糖、葡萄糖含量.安徽农业科学.2011.39(24). 14988-14989,14992.
32)吴自明,江安庆,张积森,叶冰莹,陈由强 .甘蔗ShSUT4基因及其5’侧翼序列的克隆与序列分析.亚热带农业研究.2012. (2)126-130.
33)胡巍,张积森,叶冰莹,陈由强,陈如凯. 甘蔗蔗糖磷酸合成酶磷酸化位点的突变及相应表达载体的构建.亚热带农业研究.2010. 6(4).77-80
34)张积森,郭春芳,王冰梅,张木清,陈由强,陈如凯.甘蔗一个水分胁迫响应相关的醛脱氢酶基因克隆及其表达特征分析.中国农业科学.2009,42(8):2676-2685.
35)刘文荣*,张积森*,饶进,蔡秋华,翁笑艳,阮妙鸿,阙友雄,陈如凯,张木清.干旱胁迫下斑茅消减文库的构建及分析,作物学报(*共同第一作者)2007,33(6):961-967.
36)张积森,李伟,阙友雄,阮妙鸿,张木清,陈如凯.斑茅两个看家基因片段的克隆及其在基因芯片中的应用.热带亚热带植物学报,2007,15(3):277-283.
37)张积森,李伟,阮妙鸿,阙友雄,陈如凯,张木清. Cloning of aco from Erianthus arundinaceus and its expression under water-stress(英文稿).热带作物学报. 2007,28(2):60-68.
38)张积森,阙友雄,李伟,阮妙鸿,张木清,陈如凯.水分胁迫下斑茅3个逆境代谢相关基因表达的实时PCR 分析.中国农学通报.2007, 5(23):49-54.
39)张积森、廖辉煌、林晓坤、陈如凯、张木清拟南芥rd29A 启动子的克隆及其在甘蔗抗逆转基因中的应用初探.中国科协第四届优秀博士生学术年会论文集:117-123,中国科学出版社.
40)张积森,黄金存,叶冰莹,陈由强,陈如凯.应用SMART 技术构建甘蔗叶片全长cDNA 文库,热带作物学报,2008,29(6):684-689
41)张积森,黄金存, 叶冰莹,陈由强,陈如凯.甘蔗ADP/ATP 转运蛋白酶基因克隆及其序列的生物信息学分析.中国农学通报,2009, 25(20):49-53
42)张积森,陈由强,郭春芳,李伟,阙友雄,叶冰莹,陈如凯,张木清.甘蔗水分胁迫响应的δ-鸟氨酸转氨酶基因克隆及分子特征分析[J].热带作物学报,2009,30(8):1062~1068.
43)张积森,陈由强,李伟,阙友雄,叶冰莹,陈如凯,张木清.甘蔗△1-吡咯啉-5-羧酸合成酶基因(P5CS)的克隆及其表达分析[J].热带作物学报,2009,30(9):1337~1344.
44)何炜,叶冰莹, 周平,郑钊,张积森,何文锦,林荣华, 陈由强,陈如凯.甘蔗果糖-6-磷酸,2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶基因的cDNA 克隆及序列分析. 福建师范大学学报. 2009,25(3): 109-113.
45)王冰梅; 张积森;黄庆煌; 叶冰莹; 陈如凯; 陈由强.马尾松银松素合酶基因转化双子叶植物表达载体的构建及鉴定. 福建师范大学学报. 2008 .24 (6)
46)You-xiong Que,Jian-wei Lin,Ji-sen Zhang, etc..Cloning and analysis of NBS class disease resistance gene analogous in sugarcane. PROC.Internl.Symp. on Technologies to Improve Sugar Productivity in Developing Countries, Gulin, P.R.China,pp 623-628(2006).
47)Q.YOU-XIONG, L.JIAN-WEI,Z.JI-SEN, R. MIAO-HONG, X. LI-PING and, Z. MU-QING.Molecular cloning and characterization of a non-TIR-NBS-LRR disease resistance gene analogue from sugarcane.Proc. Int. Soc. Sugar Cane Technol., Vol. 26, 2007.
48)林荔辉,陈志伟,张积森,吴为人,周元昌,唐定中,利用回交和MAS 技术改良珍汕97B 的白叶枯病抗性. 福建农林大学学报(自然科学版). 2004 Vol.33 No.3 P.280-283.
49)蔡秋华张积森郭春芳等.高等植物体内多胺的生理功能及其分子生物学研究进展. 福建教育学院学报.2006 年,第10 期
50)阮妙鸿, 许燕,郑瑶,杨川毓, 张积森,阙友雄,陈如凯,张木清.转ScMV-CP 基因甘蔗对土壤微生物的影响,热带作物学报2008 年02 期
51)阙友雄,许莉萍,张木清,徐景升,张积森,陈如凯.甘蔗中一个NBS-LRR 类基因的全长克隆与表达分析,作物学报.2009, 35(6): 1161−1166
52)阙友雄,许莉萍,徐景升,张积森,张木清,陈如凯. 甘蔗基因表达定量PCR 分析中内参基因的选择.热带作物学报.2009.30(3):274-278.
53)阙友雄,许莉萍,林剑伟,徐景升,张积森,张木清,陈如凯.利用斑茅cDNA 芯片研究甘蔗受黑穗病菌侵染后基因差异表达, 作物学报2009, 35(5) 940-945
54)曹罗元,叶冰莹,张积森, 陈由强,陈如凯. Cre/loxP系统介导删除酿酒酵母ALD_4基因研究.中国酿造,2009(03).20-23.
55)郭春芳 张积森 张木清 陈如凯.外源ABA和乙烯利胁迫下斑茅ACO基因表达的实时PCR分析. 中国农学通报, 2008(2): 48-52.
56)蔡秋华;张积森;刘文荣;饶进;翁笑艳;陈如凯;张木清.斑茅SAMDC 基因的克隆及其原核表达分析.福建稻麥科技. Vol.27 No.1 (2009/03). 17-20.
57)连玲 叶冰莹 何炜 张积森 何文锦 陈由强 陈如凯. 甘蔗UGPasecDNA 的克隆及序列分析. 福建师范大学学报(自然科学版).2009(3):105-109.
58)翁笑艳; 阮妙鸿; 张积森; 郭春芳; 郭莺; 张木清; 水分胁迫下Ca~(2+)与甘蔗内源ABA的关系.武夷科学. 2007(23):1-5.
会议论文
59)Jisen Zhang , Ray Ming. Haplotype Analysis ofThe SuSy Gene Family In Three Saccharum Species.
(http://www.intl-pag.org/19/abstracts/W47_PAGXIX_318.html)(2010 PAG 会议论文摘要)
60)叶冰莹, 陈由强, 黄金存,周平,张积森.甘蔗果糖-1,6-二磷酸酯酶的cDNA 克隆及序列分析,中国植物学会七十五周年年会(2008年会议论文)
61)陈由强,叶冰莹, 周平, 黄金存,张积森.甘蔗蔗糖磷酸合成酶基因表达及转录调控机制的研究.中国植物学会七十五周年年会(2008年会议论文)
62)张积森,张木清,郭春芳, 陈由强,叶冰莹,陈如凯.甘蔗脯氨酸代谢两个关键酶基因的克隆及表达分析,中国植物学会七十五周年年会(2008年会议论文)
63)Jisen Zhang ,Qiong Zhang , Lei-Ting Li , Ray Ming.Recent Polyploidization and Genome Evolution In Saccharum(2013年PAG会议报告:https://pag.confex.com/pag/xxi/webprogram/Paper5287.html)
投稿论文
64)Jisen Zhang, Anupma Sharma, Qingyi Yu, Jianping Wang, Leiting Li, Lin Zhu,Xingtan Zhang, Youqiang Chen, Ray Ming.*Strong directional selection in the Bru1 Genomic Region in Saccharum spontaneum. BMC Genomics.(In revision).
国际会议报告:
Jisen Zhang , Ray Ming. Haplotype Analysis Of The SuSy Gene Family In Three SaccharumSpecies.(链接:http://www.intl-pag.org/19/abstracts/W47_PAGXIX_318.html)(2010 PAG 会议论文摘要).
专利:
张木清、张积森、陈如凯.专利号: 200810070622,名字:斑茅抗旱cDNA表达谱芯片及其应用。
教学:
基因组学与蛋白质组学(研究生课程);植物组织培养(本科生课程);生物化学实验(本科生课程);有机化学实验(本科生课程);生物信息学(博士生课程);生物化学进展(研究生课程)。
指导本科生:共16名。在福建农林大学指导本科生共4名,其中两名(张小丹和梁玉虎)获得作物学院优秀毕业论文。
指导研究生:在读博士2名,硕士12名。已毕业硕士研究4名。

张积森教授课题组合影

 
版权所有◎福建农林大学基因组与生物技术研究中心 地址:福建省福州市仓山区上下店路15号

后台管理